Stephan Baumecker studierte von 1984 bis 1988 Schauspiel an der Hochschule für Schauspielkunst „Ernst Busch“ Berlin. Nach dem Studium war er festes Ensemblemitglied u. a. am Nationaltheater Weimar, am Schillertheater Berlin, am Schauspielhaus Bochum, am Faust Ensemble und dem Berliner Ensemble und arbeitete dort mit renommierten Regisseuren wie Leander Haußmann, Dimiter Gotscheff, Jürgen Kruse, Werner Schroeter, Peter Stein, Robert Wilson und Claus Peymann zusammen. Seit 2006 ist er freischaffend tätig, unter anderem an der Volksbühne Berlin, dem Staatstheater Wiesbaden und dem Schauspielhaus Leipzig und war in vielen nationalen TV-Serien und Filmen wie „Herr Lehmann“, „Hai-Alarm am Müggelsee“, „Berlin, Berlin“, „Löwenzahn“, „Tatort“, „Polizeiruf 110“, „SOKO Wismar“ und vielen anderen zu sehen. Von 2009 bis 2010 spielte er die männliche Hauptrolle des Martin Ahrens in der ARD-Telenovela „Rote Rosen“.