Er studierte am Royal College of Music in London und reüssierte zunächst als Pianist. Nach Gründung eines eigenen Ensembles entschloss er sich, als Dirigent zu
arbeiten. Inzwischen ist er einer der gefragtesten Dirigenten seiner Generation und arbeitet u. a. mit dem Los Angeles Philharmonic Orchestra, dem St. Paul Chamber Orchestra und dem Tokyo Symphony Orchestra. 2007 führen ihn Engagements nach Chicago und Santiago. 1988 gab er mit MACBETH sein Operndebüt an der Wiener Staatsoper und wurde dort 1991 Ständiger Gastdirigent. Ferner dirigiert er u. a. an den Opernhäusern in Paris, Hamburg und Rom. Von 1997 bis 2002 war Jan Latham Koenig GMD des Orchestre Philharmonique de Strasbourg und der Opéra National du Rhin. Sein Debüt an der DOB gab er 2002 mit einem Konzert.